Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
MKRN3Q13064 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
MKRN3Q13064 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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