Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXC1Q12948 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXC1Q12948 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXC1Q12948 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXC1Q12948 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXC1Q12948 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXC1Q12948 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXC1Q12948 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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