Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
USP18Q9UMW8 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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