Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ATG3Q9NT62 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ATG3Q9NT62 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms