Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFKB1-212ENST00000600343 4010 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPM3-203ENST00000358082 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPM3-215ENST00000408909 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNMA1-248ENST00000638991 11990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CGNL1-201ENST00000281282 7224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AFG1L-201ENST00000368977 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC3□□□□□ -1.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms