Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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ECM1Q16610 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ECM1Q16610 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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