Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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DDB1Q16531 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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