Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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NKX1-1Q15270 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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NKX1-1Q15270 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NKX1-1Q15270 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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