Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
APOFQ13790 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
APOFQ13790 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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APOFQ13790 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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APOFQ13790 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
APOFQ13790 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
APOFQ13790 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
APOFQ13790 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
APOFQ13790 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
APOFQ13790 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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APOFQ13790 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
APOFQ13790 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
APOFQ13790 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
APOFQ13790 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
APOFQ13790 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
APOFQ13790 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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