Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FHL3Q13643 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms