Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms