Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
TCOF1Q13428 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
TCOF1Q13428 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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