Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms