Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
NR1H3Q13133 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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NR1H3Q13133 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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NR1H3Q13133 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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NR1H3Q13133 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
NR1H3Q13133 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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