Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
TRAF3Q13114 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms