Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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SPG7Q9UQ90 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SPG7Q9UQ90 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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