Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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MEIS3Q99687 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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MEIS3Q99687 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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MEIS3Q99687 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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MEIS3Q99687 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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MEIS3Q99687 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
MEIS3Q99687 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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