Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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PTPRNQ16849 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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PTPRNQ16849 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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PTPRNQ16849 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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PTPRNQ16849 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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PTPRNQ16849 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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PTPRNQ16849 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PTPRNQ16849 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PTPRNQ16849 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRNQ16849 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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