Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK5Q16478 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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