Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
GAPVD1Q14C86 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GAPVD1Q14C86 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GAPVD1Q14C86 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GAPVD1Q14C86 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GAPVD1Q14C86 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GAPVD1Q14C86 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GAPVD1Q14C86 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GAPVD1Q14C86 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
GAPVD1Q14C86 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
GAPVD1Q14C86 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GAPVD1Q14C86 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GAPVD1Q14C86 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms