Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CHD4Q14839 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms