Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
IRF5Q13568 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms