Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SNTA1Q13424 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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