Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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PSMB5P28074 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PSMB5P28074 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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PSMB5P28074 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PSMB5P28074 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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