Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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