Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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LHX8Q68G74 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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LHX8Q68G74 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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LHX8Q68G74 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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LHX8Q68G74 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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LHX8Q68G74 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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LHX8Q68G74 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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LHX8Q68G74 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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LHX8Q68G74 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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LHX8Q68G74 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AC133485.2-201ENST00000566232 2484 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
LHX8Q68G74 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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