Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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