Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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NKX1-1Q15270 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
NKX1-1Q15270 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
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