Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SMCO1Q147U7 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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