Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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TCOF1Q13428 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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TCOF1Q13428 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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TCOF1Q13428 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TCOF1Q13428 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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TCOF1Q13428 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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TCOF1Q13428 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TCOF1Q13428 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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