Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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BNIP1Q12981 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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BNIP1Q12981 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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BNIP1Q12981 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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BNIP1Q12981 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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BNIP1Q12981 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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BNIP1Q12981 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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BNIP1Q12981 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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BNIP1Q12981 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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BNIP1Q12981 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BNIP1Q12981 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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