Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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DDB1Q16531 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
DDB1Q16531 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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