Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TTF1Q15361 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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