Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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FOXC1Q12948 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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FOXC1Q12948 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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FOXC1Q12948 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXC1Q12948 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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