Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TMOD4Q9NZQ9 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms