Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RABGGTAQ92696 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTAQ92696 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTAQ92696 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTAQ92696 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTAQ92696 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTAQ92696 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RABGGTAQ92696 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RABGGTAQ92696 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RABGGTAQ92696 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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RABGGTAQ92696 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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RABGGTAQ92696 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RABGGTAQ92696 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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