Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD42Q8N9B4 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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