Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRNQ16849 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRNQ16849 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRNQ16849 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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PTPRNQ16849 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PTPRNQ16849 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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