Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms