Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FXNQ16595 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FXNQ16595 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms