Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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