Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms