Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SHROOM2Q13796 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SHROOM2Q13796 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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