Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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SKP2Q13309 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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SKP2Q13309 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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SKP2Q13309 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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SKP2Q13309 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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SKP2Q13309 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
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SKP2Q13309 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SKP2Q13309 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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