Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms