Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRDNQ13061 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms