Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CDC16Q13042 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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