Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ATRXP46100 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ATRXP46100 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ATRXP46100 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATRXP46100 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATRXP46100 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATRXP46100 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATRXP46100 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ATRXP46100 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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