Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTPRAP18433 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTPRAP18433 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTPRAP18433 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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PTPRAP18433 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRAP18433 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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