Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.7 ms